Зачет излишне уплаченных пеней: с какой проблемной ситуацией могут столкнуться налогоплательщики?

Что произошло?

4 сентября 2024 года Арбитражный суд города Москвы поддержал компанию АО «Фарм-Синтез» в споре против ИФНС №31 в деле № А40-112725/2024. Данный спор может помочь налогоплательщикам, которые столкнулись с проблемами при проведении зачета переплаты после введения ЕНС с 2023 года.

Фактические обстоятельства

В отношении АО «Фарм-Синтез» (далее – «Общество») была проведена выездная налоговая проверка в 2015 году, по итогам которой налогоплательщику были доначислены суммы налога на прибыль и НДС. Указанные суммы налогов были уплачены Обществом 14.02.2020. 

Общество, не согласившись с Решением по проверке, обжаловало его в суде. По итогам обжалования требования Общества были частично удовлетворены, что привело к образованию переплаты в размере 166 157 454 руб. Решение суда первой инстанции вступило в силу 25.11.2021.

Впоследствии часть переплаты была зачтена в счет предстоящих платежей Общества по налогам и сборам. В отношении оставшейся части в размере 15 024 734,29 руб. Обществом были поданы заявления о зачете переплаты в декабре 2022 года.

01.01.2023 в адрес Общества были направлены решения об отказе в зачете переплаты в связи с переходом на ЕНС и введением новой формы заявления на зачет.

В соответствии с положениями НК РФ в редакции, действовавшей до вступления в силу Закона 263-ФЗ, налогоплательщик имел право обратиться с заявлением о возврате или зачете суммы излишне уплаченного налога в течение трех лет с момента уплаты налога. 

Однако ввиду отсутствия у Общества корректного положительного сальдо на ЕНС (по состоянию на 01.01.2023 у Общества отсутствовала переплата) Общество до 14.02.2023 не смогло переподать заявление на зачет по новой форме и воспользоваться правом на зачет. 

По итогам дальнейшего досудебного обжалования вышестоящий налоговый орган отказал Обществу в зачете переплаты по формальному основанию – истечение трех лет с даты уплаты налога. 

В результате Общество обратилось в суд с заявлением об обязании налогового органа зачесть переплату в счет предстоящих платежей по НДС.

Выводы суда

По итогам рассмотрения данного спора суд пришел к выводу о том, что Общество вправе воспользоваться правом на зачет переплаты в течение 3 лет с момента вынесения судебного решения судом первой инстанции, то есть по 25.11.2024 включительно. Иными словами, течение срока давности должно начинаться с момента, когда Общество узнало о наличии у него переплаты (25.11.2021), а не с даты фактической уплаты налогов, доначисленных по итогам проверки (14.02.2020):

«Общество допустило переплату налогов и пеней по причине исполнения Решения, признанного впоследствии судами недействительным (в части), поскольку в соответствии с налоговым законодательством было обязано уплатить суммы недоимки и пеней после вступления указанного Решения в законную силу. При этом о том, что часть суммы недоимки и пеней является излишне уплаченной, Общество узнало только в момент вступления в силу Решения Суда первой инстанции, то есть после принятия Постановления апелляционного суда (25.11.2021 г.)»

***

После перехода налогоплательщиков на ЕНС многие компании столкнулись с некорректным отражением сальдо ЕНС. Отображение некорректных данных на ЕНС привело к тому, что налогоплательщики не смогли своевременно воспользоваться правом на зачет переплаты. При этом, как показывает практика, налоговые органы не спешат корректировать сальдо ЕНС, а досудебное обжалование, как правило, не приносит результата. 

С учетом данного спора налогоплательщикам, которые столкнулись с аналогичной ситуацией, целесообразно еще раз проанализировать порядок исчисления сроков на зачет и в случае, если срок еще не истек, обратиться в суд за защитой своих прав.