Türkiye Prnp
⚡ TÜM BİLGİLER! BURAYA TIKLAYIN 👈🏻👈🏻👈🏻
Türkiye Prnp
Yıl: 2017 Cilt: 33 Sayı: 1 Sayfa Aralığı: 20 - 25 Metin Dili: Türkçe
Şahin İ, Bulut Z, Kurar E, Özşensoy Y, Doğan M, Nizamlıoğlu M. Türkiye'de bulunan bazı sığır ırklarının DGAT1 ve PRNP gen polimorfizminin araştırılması.Amaç: Sunulan çalışmada, Türkiye yerli sığır ırklarında DGAT1 geni K232A ile PRNP geni promotor ve intron 1 bölgelerinde indel polimorfizmleri araştırılmıştır.Gereç ve Yöntem: Çalışmada materyal olarak, Boz Irk (BI), Yerli Kara (YK), Doğu Anadolu Kırmızısı (DAK), Güney Doğu Anadolu Kırmızısı (GAK) ve Zavot ırklarından olmak üzere toplam 122 kan örneği kullanıldı. Örnekler üzerinde DGAT1 geni K232A polimorfizmi Polimeraz Zincir Reaksiyonu- Parça Uzunluk Polimorfizmi (PZR-RFLP) tekniği kullanılarak ve PRNP geninin promotor bölgesi (23 bç indel) ile intron 1 bölgesi (12 bç indel) insersiyon-delesyon (indel) polimorfizmi PZR tekniği kullanılarak belirlendi. Bulgular: DGAT1 geninde A allelin en yüksek sıklığı YK (0,58) daha sonra GAK ve Zavot'da (0.50), en düşük sıklığı ise BI ve DAK'da (0.38) gözlendi. PRNP promotor ve intron 1 indel polimorfizmi için yapılan genotiplemede; promotor bölgesi en yüksek del/del genotipi sıklığı DAK ve GAK (sırası ile 0.53-0.52), en düşük BI ve Zavot (sırası ile 0.19 ve 0.17) ırklarında, intron 1 bölgesi del/del genotipi en yüksek sıklığı ise BI ve GAK (sırası ile 0.25-0.13), daha sonra YK (0.08) en düşük sıklığı DAK ve Zavot (0.05)'da görüldü.Öneri: BI, YK, DAK, GAK ve Zavot ırklarında yürütülen bu çalışmaile elde edilen verilerin, bu sığır ırklarında süt özelliği ileDGAT1 ve PRNP gen polimorfizmi arasındaki korelasyon ile ilgiliçalışmalarda yararlı olacağı, hayvan yetiştiriciliği ve ıslah çalış-malarında süt verimi yönünden seleksiyona katkı sağlayacağıdüşünülmektedir.
Konular: Fen > Veterinerlik > Veterinerlik Fen > Veterinerlik
. Aim: In the present study, DGAT1 gene K232A and promoter and intron 1 indel polymorphisms of PRNP gene were studied. Materials and Methods: Samples were collected a total of 122 animals including Turkish Grey (AG), Anatolian Black (AB), South Anatolian Red (SAR), East Anatolian Red (EAR) ve Zavot breeds were used for the study. The samples were genotyped for DGAT1 K232A polymorphism (A and K allel) using the polymerase chain reaction-restriction fragment lenght polymorphisms (PCR-RFLP) technique. PRNP gene polymorphism in the promoter (23 bp indel) and intron 1 regions (12 bp indel) were determined by PCR analysis. Results: The highest frequency of A allele in DGAT1 gene was found in the AG (0.58), followed by SAR and Zavot (0.50), AG and EAR showed the lowest frequencies of A allele (0.38). The highest frequency of del/del genotype in promoter region of PRNP gene was found in the EAR and SAR (0.53 and 0.52, respectively) followed by AG (0.46); however, AB (0.19) and Zavot (0.17) showed the low frequencies. In intron 1 region of PRNP, the highest frequency of del/del genotype was found in the AG (0.25) and EAR (0.13), followed by AB (0.08). The lowest frequency (0.05) of del/del genotype was observed in EAR and Zavot.Conclusion: Results of the present study on AG, AB, SAR, EAR and Zavot breeds could be used to guide association studies between DGAT1 and PRNP gene polymorphisms may be useful for selection of milk traits on animal husbandry and reclamation studies
Konular: Fen > Veterinerlik > Veterinerlik Fen > Veterinerlik
Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık
Czarnik U, Zabolewicz T, Strychalski J, Grzybowski G, Bogusz M, 2007. Deletion-insertion polymorphism in the prion protein gene (PRNP) in Polish Holstein-Friesian cattle. J Appl Genet, 48, 69-71. Grisart B, Coppieters W, Farnir F, Karim L, Ford C, Berzi P, Cambisano N, Mni M, Reid S, Simon P, Spelman R, Georges M, Snell R, 2002. Positional candidate cloning of a QTL in dairy cattle: Identification of a missense mutation in the bovine DGAT1 gene with major effect on milk yield and composition. Genome Res, 12, 222-231. Grisart B, Farnir F, Karim L, Cambisano N, Kim JJ, Kvasz A, Mni M, Simon P, Frere JM, Coppieters W, 2004. Genetic and functional confirmation of the causality of the DGAT1 K232A quantitative trait nucleotide in affecting milk yield and composition. Proc Natl Acad Sci, 101, 2398-2403. Haldane JBS, 1954. An exact test for randomness of mating. J Genet, 52, 631-635. Juling K, Schwarzenbacher H, Williams J.L, Fries R, 2006. A major genetic component of BSE susceptibility. BMC Biol, 4, 33. Kepenek EŞ, 2007. Polymorphism of prolactin (PRL), diacylglycerol acyltransferase (DGAT-1) and bovine solute carrier family 35 member 3 (SLC35A3) genes in native cattle breeds and its implication for Türkish cattle breeding. Yüksek Lisans Tezi, Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Ankara. Kühn C, Thaller G, Winter A, Bininda-Emonds ORP, 2004. Evidence for multiple alleles at the DGAT1 locus better explains a quantitative trait locus with major effect on milk fat content in cattle. Genetics, 167, 1873-1881. Lacorte GA, Machado MA, Martinez ML, Campos AL, Maciel RP, Verneque RS, Teodoro RL, Peixoto MGCD, Carvalho MRS, Fonseca CG, 2006. DGAT1 K232A polymorphism in Brazilian Cattle Breeds. Genet Mol Res, 5, 475-482. Miller MP, 1997. Tools for population genetic analyses (TFPGA) 1.3. Näslund J, Fikse WF, Pielberg GR, Lundén A, 2008. Frequency and effect of the bovine acylcoA:diacylglycerol acyltransferase 1 (DGAT1) K232A polymorphism in Swedish Dairy Cattle. J Dairy Sci, 91, 2127-2134. Pareek SC, Czarnik U, Zabolewicz T, Pareek RS, Walawski K, 2005. DGAT1 K232A quantitative trait nucleotide polymorphism in Polish Black-and-White cattle. J Appl Genet, 46, 85-87. Sander P, Hamann H, Pfeifer I, Wemheuer W, Breng B, Groschup MH, Ziegler U, Distl O, Leeb T, 2004. Analysis of sequence variability of the bovine prion protein gene (PRNP) in German cattle breeds. Neurogenetics, 5, 19-25. Seabury CM, Womack EJ, Piedrahita J, Derr NJ, 2004. Comparative PRNP genotyping of U.S. cattle for potential association with BSE. Mamm Genome, 15, 828-833. Spelman RJ, Ford CA, McElhinney P, Gregory GC, 2002. Characterization of the DGAT1 gene in the New Zealand dairy population. J Dairy Sci, 85, 3514-3517. Ulubaş B, Günay M, 2004. Pratik sığırcılık, In: Sığır ırklarımız, Ed; Yazar U, Teşkilatlanma ve Destekleme Genel Müdürlü- ğü Yayım Dairesi Baskanlığı, Ankara, Türkiye, pp; 1-5. Ünal RN, Besler HT, 2006. http://sdb.meb.gov.tr/ok ulsagligi/ beslenmede_sutun_onemi.pdf. Erişim tarihi; 04.05.2010. Walawski K, 1999. Genetic aspects of mastitis resistance in cattle (review). J Appl Gent, 40, 117-128. Weller JI, Golik M, Seroussi E, Ezra E, Ron M, 2003. Population-wide analysis of a QTL affecting milkfat production in the Israeli Holstein population. J Dairy Sci, 86, 2219-2227. Winter A, Kramer W, Werner FAO, Kollers S, Kata S, Durstewitz G, Buitkamp J, Womack JE, Thaller G, Fries R, 2002. Association of a lysine- 232/alanine polymorphism in a bovine gene encoding acyl-CoA: diacylglycerol acyltransferase (DGAT1) with variation at a quantitative trait locus for milk fat content. Proc Nat Acad Sci, 99, 9300-9305.
TÜBİTAK ULAKBİM Ulusal Akademik Ağ ve Bilgi Merkezi Cahit Arf Bilgi Merkezi © 2021 Tüm Hakları Saklıdır. Gizlilik Politikası Kullanım Şartları
Türkiye’de bulunan bazı sığır ırklarının DGAT1 ve PRNP gen polimorfizminin araştırılması
Investigation of DGAT1 and PRNP gene polymorphism of various cattle breeds in Turkey
Yüzüncüyıl, İşçi Blokları Mahallesi
06530 Çankaya / ANKARA +90 (312) 298 92 00
ŞAHİN İ, BULUT Z, KURAR E, ÖZŞENSOY Y, DOĞAN M, NİZAMLIOĞLU M (2017). Türkiye’de bulunan bazı sığır ırklarının DGAT1 ve PRNP gen polimorfizminin araştırılması. Eurasian Journal of Veterinary Sciences, 33(1), 20 - 25.
ŞAHİN İclal,BULUT ZAFER,KURAR ERCAN,ÖZŞENSOY YUSUF,DOĞAN Müge,NİZAMLIOĞLU MEHMET Türkiye’de bulunan bazı sığır ırklarının DGAT1 ve PRNP gen polimorfizminin araştırılması. Eurasian Journal of Veterinary Sciences 33, no.1 (2017): 20 - 25.
ŞAHİN İclal, BULUT ZAFER,KURAR ERCAN,ÖZŞENSOY YUSUF, DOĞAN Müge, NİZAMLIOĞLU MEHMET Türkiye’de bulunan bazı sığır ırklarının DGAT1 ve PRNP gen polimorfizminin araştırılması. Eurasian Journal of Veterinary Sciences, vol.33, no.1, 2017, ss.20 - 25.
ŞAHİN İ, BULUT Z,KURAR E,ÖZŞENSOY Y, DOĞAN M, NİZAMLIOĞLU M Türkiye’de bulunan bazı sığır ırklarının DGAT1 ve PRNP gen polimorfizminin araştırılması. Eurasian Journal of Veterinary Sciences. 2017; 33(1): 20 - 25.
ŞAHİN İ, BULUT Z,KURAR E,ÖZŞENSOY Y, DOĞAN M, NİZAMLIOĞLU M Türkiye’de bulunan bazı sığır ırklarının DGAT1 ve PRNP gen polimorfizminin araştırılması. Eurasian Journal of Veterinary Sciences. 2017; 33(1): 20 - 25.
ŞAHİN İ, BULUT Z,KURAR E,ÖZŞENSOY Y, DOĞAN M, NİZAMLIOĞLU M "Türkiye’de bulunan bazı sığır ırklarının DGAT1 ve PRNP gen polimorfizminin araştırılması." Eurasian Journal of Veterinary Sciences, 33, ss.20 - 25, 2017.
Sunulan çalışmada, Türkiye yerli sığır ırklarında DGAT1 geni K232A ile PRNP geni promotor ve intron 1 bölgelerinde indel polimorfizmleri araştırılmıştır. Çalışmada materyal olarak, Boz Irk (BI), Yerli Kara (YK), Doğu Anadolu Kırmızısı (DAK), Güney Doğu Anadolu Kırmızısı (GAK) ve Zavot ırklarından olmak üzere toplam 122 kan örneği kullanıldı. Örnekler üzerinde DGAT1 geni K232A polimorfizmi Polimeraz Zincir Reaksiyonu- Parça Uzunluk Polimorfizmi (PZR-RFLP) tekniği kullanılarak ve PRNP geninin promotor bölgesi (23 bç indel) ile intron 1 bölgesi (12 bç indel) insersiyon-delesyon (indel) polimorfizmi PZR tekniği kullanılarak belirlendi. DGAT1 geninde A allelin en yüksek sıklığı YK (0,58) daha sonra GAK ve Zavot’da (0.50), en düşük sıklığı ise BI ve DAK’da (0.38) gözlendi. PRNP promotor ve intron 1 indel polimorfizmi için yapılan genotiplemede; promotor bölgesi en yüksek del/del genotipi sıklığı DAK ve GAK (sırası ile 0.53-0.52), en düşük BI ve Zavot (sırası ile 0.19 ve 0.17) ırklarında, intron 1 bölgesi del/del genotipi en yüksek sıklığı ise BI ve GAK (sırası ile 0.25-0.13), daha sonra YK (0.08) en düşük sıklığı DAK ve Zavot (0.05)’da görüldü. BI, YK, DAK, GAK ve Zavot ırklarında yürütülen bu çalışma ile elde edilen verilerin, bu sığır ırklarında süt özelliği ile DGAT1 ve PRNP gen polimorfizmi arasındaki korelasyon ile ilgili çalışmalarda yararlı olacağı, hayvan yetiştiriciliği ve ıslah çalışmalarında süt verimi yönünden seleksiyona katkı sağlayacağı düşünülmektedir.
Anahtar kelimeler: Sığır, DGAT1 geni, PRNP geni
Content may be subject to copyright.
Eurasian J Vet Sci, 2017, 33, 1, 20-25
Türkiy e’de bulunan bazı sığır ırklarının DGAT1 v e PRNP
Şahin İ, Bulut Z, Kurar E, Özşensoy Y, Doğan M, Nizamlıoğlu
M.
Amaç:
geni K232A ile PRNP geni promotor ve intron 1 bölgelerinde in-
Gereç ve Yöntem: -
-
-
promotor bölgesi (23 bç indel) ile intron 1 bölgesi (12 bç indel)
-
Bulgular:
DAK’da (0.38) gözlendi. PRNP promotor ve intr on 1 indel poli-
-
Öneri: -
-
Anahtar kelimeler:
Sahin l, Bulut Z, Kurar E, Ozsensoy Y , Dogan M, Nizamlioglu
M. Investigation of DGAT1 and PRNP gene pol ymorphism of va-
Aim: In the present study , DGAT1 gene K232A and promoter and
intron 1 indel polymorphisms of PRNP gene were studied.
Materials and Methods: Samples were collected a total of 122
animals including Turkish Grey (AG), Anatolian Black (AB), So-
uth Anatolian Red (SAR), East Anatolian Red (EAR) v e Zavot bre-
eds were used for the study . The samples were genotyped for
DGAT1 K232A polymorphism (A and K allel) using the pol yme-
rase chain reaction-restriction fragment lenght pol ymorphisms
(PCR-RFLP) technique. PRNP gene polymorphism in the promo-
ter (23 bp indel) and intron 1 regions (12 bp indel) were deter-
Results: The highest frequency of A allele in DGAT1 gene was
found in the AG (0.58), followed by SAR and Za vot (0.50), AG and
EAR showed the lowest frequencies of A allele (0.38). The hig-
hest frequency of del/del genotype in promoter region of PRNP
gene was found in the EAR and SAR (0.53 and 0.52, respectiv ely)
-
wed the low frequencies. In intron 1 region of PRNP , the highest
frequency of del/del genotype was found in the AG (0.25) and
EAR (0.13), followed by AB (0.08). The lowest frequency (0.05)
of del/del genotype was observed in EAR and Zavot.
Conclusion: Results of the present study on AG, AB, SAR, E AR
and Zavot breeds could be used to guide association studies bet-
ween DGAT1 and PRNP gene pol ymorphisms may be useful for
selection of milk traits on animal husbandry and reclamation
Key words: Cattle, DGA T1 gene, PRNP gene
Eurasian J V et Sci, 2017, 33, 1, 20-25
-
-
-
Winter ve ark 2002, W eller ve ark 2003, Grisart ve ark 2004),
DGAT1 geninin 8. eksonunda 10 433 v e 10 434 pozisyonun-
da bulunan adenin-adenin (AA) nükleotidlerinin, guanin-si-
-
minin 232. pozisyonunda bulunan Lizin (K) amino asidinin
-
-
-
bölgesindeki 12 bç insersiyon-delesyon (indel) v e promotor
-
Etik Kurulu (SÜVFEK)’nun 11.03.2009 tarih ve 2009/027 sa-
Eurasian J Vet Sci, 2017, 33, 1, 20-25
-
lik (bç) fragmenti ve PRNP gen bölgesinin 47784-47883 ve
-
-
PZR buffer (Fermentas), 200 mM dNTP (F ermentas), 1.5 mM
PZR, MJ Research PTC-200 thermal cycler v e touchdown PZR
-
-
-
-
-
meden sonra DGA T1 geni PZR ürünlerinde RFLP analizi için
-
Verilerin istatistiksel analizi TFPGA v1.3.8 (Miller , 1997)
elektroforezinde yürütüldü. CfrI kesimi ile PZR ürünü (411
-
Eurasian J Vet Sci, 2017, 33, 1, 20-25
Resim 1. DGAT1 geninin 10230 – 10644 gen bölgesin
% 100 Türk Gizli Çekim Adult
Çizgi Film Pornosu Siteleri Formlarda
Türk Liseli Doktor