Дрожжевой биосеснсор каннабиноидов
БиоЛогикаСовсем недавно учёные разработали биосенсор, который можно легко использовать «в полевых условиях»: на таможне или перед спортивными соревнованиями. При этом лабораторного оборудования и специалистов не требуется! Девайс с таким биосенсором содержит целые дрожжевые клетки, запрограммированные особым образом. Чтобы обнаружить вещество (в данном случае — каннабиноид), клетки используют рецепторы GPCR.
Чем круты GPCR?
GPCR (G-protein-coupled receptors) — это огромное семейство рецепторов эукариот, важное для самых разных процессов в организме. Именно благодаря этим рецепторам мы можем видеть, ощущать вкус и запах. Также GPCR играют ключевую роль в работе эндокринной и иммунной системы: за счет GPCR клетки распознают сигнальные молекулы и реагируют на них.
Поэтому в ходе эволюции GPCR рецепторы приобрели способность распознавать самые разные стимулы: небольшие химические соединения, белковые сигналы и даже свет! Этот факт позволяет использовать GPCR в биотехнологиях, чтобы специфично обнаруживать огромное разнообразие соединений.
GPCR называются так потому, что они взаимодействуют с G-белками (G-protein-coupled), которые передают сигнал дальше в клетку. Вот как это работает: когда сигнала нет, G-белок находится в комплексе с рецептором, при этом его α-субъединица связана с веществом GDP. Когда приходит сигнал и активирует рецептор, G-белок меняет свою конформацию, при этом комплекс с рецептором разрушается. При этом α-субъединица тоже отваливается, но связанный с ней GDP заменяется на GTP. Теперь субъединицы G-белка свободны, они взаимодействуют с другими мембранными белками и запускают различные реакции. Что именно происходит дальше — зависит от типа G-белка.
Откуда у дрожжей нужные сигнальные пути?
Марихуана оказывает влияние на нервную систему человека, потому что там есть каннабиноидные рецепторы CB1 и CB2, именно они активируются действующими веществами марихуаны. При этом активируются определенные сигнальные пути
Но дрожжи сильно отличаются от человека по набору сигнальных путей! Казалось бы, если просто генетически модифицировать дрожжей и вставить им гены каннабиноидных рецепторов, это не сработает, ведь рецептор связан с целым сигнальным путем.
Однако на деле дрожжей легко заставить реагировать на каннабиноиды! Дело в том, что у дрожжи обмениваются феромонами, и рецепторы этих феромонов тоже относятся к семейству GPCR. При этом соответствующий сигнальный путь совпадает с человеческим, он вообще довольно консервативен (то есть мало отличается у самых разных организмов). Поэтому биотехнологам остаётся только заменить феромоновый рецептор на каннабиноидный, чтобы система распознавания заработала.
Как работает биосенсор?
Итак, мы разобрались с тем, как происходит распознавание действующего вещества марихуаны — за это ответственны рецепторы из семейства GPCR, а также поняли, почему у дрожжей есть соответствующие сигнальные пути. Но кроме собственно детекции каннабиноидов, биосенсор, как и любой другой прибор, должен сообщить о том, что вещество обнаружено.
Биологи используют для этого гены-репортёры. Их встраивают ДНК рядом с геном, активацию которого хотят выявить, и они активируются вместе. Сам репортёр светится, флюоресцирует или придаёт клетке другое свойство, которое позволяет легко отличить активированные клетки.
В данном случае учёные разработали биосенсор с модульной структурой, за счёт этого в качестве репортёра могут использоваться разные варианты:
Другие модули (рецептор, адаптер и актуатор) также могут быть заменены, что невозможно для простых, немодицифированных, дрожжей. Это позволяет использовать данные наработки для детекции разных веществ (нужно просто заменить рецептор с адаптором) и для использования в разных областях, ведь в каких-то случаях удобнее использовать изменение цвета в качестве сигнала, а в других — флуоресценцию.
Пример реального применения
Детекция каннабиоидов — это сложная задача, так как они могут быть довольно разными с точки зрения химической структуры. Для этого хорошо подходят рецепторы млекопитающих, но биосенсоры на основе клеток млекопитающих — это сложно и дорого, вряд ли их разумно использовать вне лаборатории. Напротив, биосенсор на основе дрожжей хорошо подходит для «полевых условий».
Чтобы доказать это, учёные разработали портабельный девайс, который можно использовать, например, на таможне или перед спортивными соревнованиями.
Вот как его можно использовать: сначала в лунку с дрожжами добавляют образец, в котором нужно выявить каннабиноиды (кровь или слюна). Затем культуру смешивают веществом, активирующим культуру дрожжей (оно в комплекте). Несколько часов — и готово, результат виден невооруженным глазом! Для простоты использования исследователи предлагают использовать приложение на смартфоне для сканирования.