تحليل الحساسية الترتيبية للتعبير الجيني التفاضلي: نموذج الحساسية

92 DEGs في vapers التي تم تحديدها بواسطة التحليل الأولي ، أظهر 75 (81.5 ٪) نتائج تعبير متوافقة عند فحصها بواسطة تحليل حساسية e-liq (الجدول التكميلي S1 )). في المقابل ، لم تسفر أي من DEGs في الأوراق التي تتميز بالتحليل الأولي ، عن نتائج تعبير تفاضلي عند اختبارها بواسطة تحليل حساسية PY. تم التعبير عن ثلاثة وخمسين من أصل 67 (79.1٪) DEGs الشائعة للمدخنين والمدخنين في ظل النموذج الأساسي ، بشكل تفاضلي بشكل متسق في vapers عند اختبارها بواسطة تحليل حساسية cum e-liq. وبالمثل ، أظهر 22 من 25 (88.0 ٪) DEGs الخاصة بـ vape في النموذج الأساسي ، نتائج تعبير تفاضلي متسقة في vapers عند تحليلها بواسطة نموذج حساسية cum e-liq. في جميع الحالات ، أسفرت DEGs في vapers ، التي أظهرت نتائج تعبير متوافقة في النموذجين ، عن ارتباطات أقوى مع مؤشر vaping في تحليل حساسية cum e-liq مقارنة بالتحليل الأولي (الجدول التكميلي S1 ). وقد انعكس هذا من خلال تعديل أصغرP -value (FDR) لكل DEG متوافق في تحليل حساسية cum e-liq من القيم المقابلة في التحليل الأولي. علاوة على ذلك ، في vapers ، كانت قيم P المعدلة ` ` المجمعة '' لجميع DEGs ، و DEGs الخاصة بـ vape ، و DEGs الشائعة ، والتي أظهرت نتائج تعبير متوافقة في ظل نماذج الحساسية الأولية ونائب e-liq ، أصغر في النموذج الأخير (تكميلي) الجدول S1 ). في كل حالة ، تم حساب قيمة P المعدلة " المجمعة " عن طريق حساب متوسط ​​P- قيم جميع الجينات تظهر نتائج ذات دلالة إحصائية متطابقة في التحليلات الأولية وتحليلات الحساسية. تشير هذه البيانات مجتمعة إلى أن الغالبية العظمى من DEGs في vapers (79.1 إلى 88.0٪) مرتبطة بشكل يعتمد على الجرعة بمؤشر vaping (cum e-liq) ولكن ليس بمؤشر التدخين السابق (PY).

لتسليط الضوء بشكل أكبر على اعتماد DEGs في الـ vapers على التعرض التراكمي لـ e-cig ، ولكن ليس على شدة ومدة التدخين السابق (PY) ، فقد تصورنا نتائج تحليلات الحساسية الأولية والخاصة بالتحليل الإلكتروني و PY للعديد من التحليلات المختارة عشوائيًا الجينات المستهدفة. يوضح الشكل  2 نتائج التصور لستة DEGs خاصة بالـ vape (اللوحة العلوية) وستة DEGs شائعة (اللوحة السفلية) في vapers مقابل. الضوابط ، على النحو الذي تحدده تحليلات الحساسية الأولية ونائب الرئيس الإلكتروني و PY. في جميع الحالات ، أظهرت الجينات المستهدفة نتائج تعبير تفاضلي ذات دلالة إحصائية متوافقة في تحليلات الحساسية الأولية والخطيرة ، ولكن ليس في تحليل حساسية PY. كانت الارتباطات بين التعبير التفاضلي للجينات المستهدفة ومؤشر vaping أقوى في تحليل حساسية cum e-liq مقارنة بالتحليل الأولي ، كما يتضح من FDR السفلي (الشكل  2 ).

علاوة على ذلك ، أجرينا تحليل حساسية PY لتقييم العلاقة بين DEGs في المدخنين وجرعة التدخين. من بين 683 DEGs في المدخنين التي تم تحديدها من خلال التحليل الأولي ، أظهر 218 (31.9 ٪) نتائج تعبير تفاضلي ذات دلالة إحصائية متوافقة في تحليل حساسية PY (الجدول التكميلي S2 ). تم التعبير عن مائة وأربعة وتسعين من أصل 616 (31.5 ٪) من DEGs الخاصة بالدخان وفقًا للنموذج الأساسي ، بشكل تفاضلي في المدخنين عند اختبارها بواسطة تحليل حساسية PY. أيضًا ، أظهر 24 من أصل 67 (35.8 ٪) من DEGs الشائعة في إطار النموذج الأساسي ، نتائج تعبير تفاضلي متسقة تحت نموذج حساسية PY ( انظر ، " المناقشة ") (الجدول التكميلي S2 ). الشكل  3يعرض توافق نتائج التعبير الجيني لستة DEGs خاصة بالدخان (اللوحة العلوية) وستة DEGs شائعة (اللوحة السفلية) في المدخنين مقابل . الضوابط ، على النحو الذي تحدده تحليلات الحساسية الأولية و PY.

المسار الجزيئي وتحليلات الشبكة الوظيفية

استخدمنا تحليل مسار الإبداع (IPA) للحصول على معلومات مفصلة من قوائم الجينات التي تم إنشاؤها بواسطة RNA-seq في الصحف والمدخنين مقارنةً بالضوابط. من بين 92 نصًا تم التعبير عنها بشكل شاذ في الصحف ، تم تعيين 81 (88.0 ٪) لمعرفات معروفة ، في حين أن 523 من أصل 683 نسخة غير منظمة في المدخنين (76.6 ٪) لديهم هوية مخصصة. تم استخدام "أداة تحليل المقارنة" في IPA لتحديد الاتجاهات البيولوجية أو أوجه التشابه والاختلاف الوظيفية في DEGs بين vapers والمدخنين.

كما هو مبين في الشكل  4 أ ، كان ' C-C Motif Chemokine Receptor 5 (CCR5) الذي يشير إلى البلاعم هو المسار الأكثر تأثراً في الصحف الإلكترونية ، مما يشير إلى وجود تفاعل بين الـ vaping والاستجابة الالتهابية ( P  = 2.15E-04). CCR5 هو مستقبل مقترن ببروتين G بسعة 41 كيلو دالتون يتم التعبير عنه في الأعضاء اللمفاوية ، مثل الغدة الصعترية والطحال ، وكذلك في كريات الدم البيضاء في الدم المحيطي ، وتحديدًا الخلايا التائية ، والضامة 25 ، 26 . عند التفاعل مع الروابط المتعددة ، بما في ذلك الروابط المتشابهة CCL3 / MIP1α و CCL4 / MIP1β (يتم تنظيمها نسبيًا في الأوراق في مجموعة البيانات الخاصة بنا) ، ينظم CCR5 الانجذاب الكيميائي للكرات البيضاء في الالتهاب 25 ، 26. استنادًا إلى تحليل التنبؤ IPA ، يتم تقليل نشاط إشارات CCR5 في الصحف الإلكترونية (الشكل  4 ب). في المدخنين ، كان مسار التمثيل الغذائي " الفسفرة المؤكسدة " (OXPHOS) غير منظم إلى حد كبير ، مما أثر على 11 من 13 جينًا لترميز بروتين الميتوكوندريا (84.6٪) (الشكل  4 أ). تقوم هذه الجينات بتشفير الوحدات البروتينية الفرعية لمجمعات الإنزيم لنظام الفسفرة المؤكسدة ، والتي تمكن الميتوكوندريا من العمل كمراكز طاقة لخلايانا 24 . تعبر الجينات المصابة عن ست وحدات فرعية من مجمع السلسلة التنفسية I (ND1 و ND2 و ND3 و ND4 و ND4L و ND5) ، ووحدة فرعية واحدة من المركب III (Cyt b) ، وثلاث وحدات فرعية من المركب IV (CO1 ، CO2 ، CO3) ، ووحدة فرعية واحدة من المركب V (ATP6) ( P  = 2.80E-06) (الشكل  4ج). تشير الزيادة الملحوظة في التعبير الجيني MT في كل من المدخنين والصحف الإلكترونية إلى تحريض الخلل الوظيفي في الميتوكوندريا والضرر في هذه المجموعات. قد يمثل هذا آلية استجابة ردود الفعل في المدخنين والصحف حيث يؤدي زيادة إنتاج البروتينات المشاركة في السلسلة التنفسية إلى مواجهة الفشل الوظيفي للميتوكوندريا ( انظر أدناه).

متجر فيب هو متجر إلكتروني متخصص في بيع نكهات المعسل العادية والإلكترونية وكذلك الشيشة العادية و الإلكترونية وكل ملحقاتها.