🔷️ انواع، نحوه سرچ و چگونگی تحلیل داده‌های "String"

📊 انواع داده‌ها در پایگاه داده String:

■ داده‌های PPI: اینها هسته اصلی پایگاه داده String هستند و اطلاعات مربوط به برهمکنش‌های بین دو پروتئین خاص را ارائه می‌دهند.

■ اطلاعات پروتئین: این شامل نام پروتئین، توالی، ساختار و سایر اطلاعات مربوط به پروتئین‌ها است.

■ اطلاعات ژنوم: این شامل اطلاعات مربوط به ژن‌هایی است که پروتئین‌ها را کدگذاری می‌کنند، مانند محل ژن‌ها روی کروموزوم و تنظیم بیان آن‌ها.

■ اطلاعات گونه‌ها: این شامل اطلاعات مربوط به گونه‌هایی است که پروتئین‌ها از آنها گرفته شده‌اند، مانند نام گونه، طبقه‌بندی و توالی ژنوم.

■ منابع: این شامل اطلاعات مربوط به منابعی است که داده‌ها از آنها گرفته شده‌اند، مانند مقالات علمی، پایگاه‌های داده و ابزارهای پیش‌بینی.

🔍نحوه جستجو در String:

با استفاده از نام پروتئین، شناسه ژن یا توالی اسیدآمینه به روش‌های مختلف در String جستجو کنید. همچنین می‌توانید بر اساس گونه، نوع PPI یا سایر معیارها بررسی کنید.

📈 نحوه تجزیه و تحلیل داده‌های String:

پایگاه String ابزارهای مختلفی برای تجزیه و تحلیل داده‌های آن ارائه می‌دهد، از جمله:

✓ نمودارهای شبکه: اینها شبکه‌هایی از پروتئین‌ها و PPIs آنها را نشان می‌دهند.

✓ تجزیه و تحلیل غنی سازی: این به شما کمک می‌کند تا تعیین کنید که آیا مجموعه خاصی از پروتئین‌ها با یک فرآیند یا بیماری خاص مرتبط هستند یا خیر.

✓ مقایسه گونه‌ها: این به شما امکان می‌دهد PPIs را بین گونه‌های مختلف مقایسه کنید.

🚫 محدودیت‌های String:

۱. به‌خاطر داشته باشید که String یک منبع کامل نیست.

۲. همه PPIs شناخته شده در String موجود نیستند.

۳. ممکن است برخی از PPIs موجود در String نادرست باشند.

۴. تفسیر نتایج String باید با احتیاط انجام شود و با سایر منابع داده تأیید شود.

✅️ در کل، String یک منبع ارزشمند برای مطالعه PPIs است. این شامل حجم عظیمی از داده‌ها است و می‌توان از آن برای جستجو، تجزیه و تحلیل و تفسیر PPIs به روش‌های مختلف استفاده کرد. با این حال، مهم است که از محدودیت‌های String آگاه باشید و نتایج آن را با احتیاط تفسیر کنید.

________________________________________

Telegram:

https://t.me/ir_bioinf_academy

Instagram:

https://www.instagram.com/ir_bioinf_academy?igsh=cGg2aWs4dXUzajJo