Есть мнение, что «1С» имеет значение «первый сорт».
Другие источники утверждают, что название компании 1С было вначале названием её собственной поисковой программы: не более 1С (одной секунды) требовалось для получения требуемой информации.
Борис Нуралиев говорит следующее: С — единственная буква на клавиатуре компьютера, которая совпадает в русском и английском вариантах, только и всего, к тому же короткие названия легко остаются в памяти. Да и при компьютерной сортировке это имя неизбежно оказывается первым в списке.
Есть предположение, что название произошло от ли́товской фразы, переводящейся как «I see», что доказывается доменным именем сайта, пишущимся не через «эс», а через «си».