Научный дайджест: 15 ноября

1.    «Полногеномный анализ метилирования ДНК и экспрессии генов у монозиготных близнецов позволяет выявить потенциальные био маркеры депрессии»

Журнал: Translational Psychiatry (IF=6.222, Q1)

Ссылка: https://doi.org/10.1038/s41398-021-01536-y

Депрессия в настоящее время является ведущей причиной инвалидности во всем мире. Авторы провели исследование эпигеномных ассоциаций (EWAS) на выборке из 58 пар монозиготных близнецов с дискордантными оценками депрессии с целью выявления конкретных эпигенетических вариантов, потенциально связанных с депрессией, и дальнейшей интеграции с данными профиля экспрессии генов.

Ассоциация уровней метилирования ДНК с оценкой депрессии была определена у 66 сайтов CpG. Эти участки расположены в 34 генах, главным образом в PTPRN2, HES5, GATA2, PRDM7 и KCNIP1. Был выделен ряд направлений онтологии, в том числе сигнальный путь Notch, болезнь Хантингтона, депривация глюкозы, сигнальный путь hedgehog, связывание ДНК и метаболический процесс нуклеиновых кислот.

Авторы обнаружили 19 дифференциально метилированных областей, некоторые из которых были расположены в GRIK2, DGKA и NIPA2. При интеграции с данными экспрессии генов показано, что HELZ2, PTPRN2, GATA2 и ZNF624 экспрессировались по-разному. При анализе сети взвешенной коэкспрессии генов один конкретный модуль положительно коррелировал с оценкой депрессии. Некоторые общие гены (включая BMP2, PRDM7, KCNIP1 и GRIK2) и условия обогащения (включая путь каскадов комплемента и коагуляции, связывание ДНК, спецификацию нейронов, дифференцировку глиальных клеток и развитие щитовидной железы) были идентифицированы при анализе метилирования и взвешенной коэкспресии. Выполненное исследование определяет конкретные эпигенетические вариации, которые в значительной степени вовлечены в регионы, функциональные гены, биологическую функцию и пути, которые опосредуют депрессивное расстройство.

 2.    «Связь между полиморфизмом A118G гена OPRM1 и суицидальной депрессией в большой группе амбулаторных пациентов с депрессией»

Журнал: Neuropsychiatric Disease and Treatment (IF=2.570, Q1)     

Ссылка: https://doi.org/10.2147/NDT.S324868

Все больше данных свидетельствует о том, что депрессия с суицидными идеями может быть специфическим фенотипом со своими характеристиками. Более того, дерегуляция опиоидной системы может быть связана с суицидальным поведением.

В работе изучали полиморфизм в ORPM1 — гене, кодирующем опиоидный рецептор mu 1, у амбулаторных пациентов с умеренной или тяжелой депрессией. Некоторые исследования с участием здоровых субъектов показали, что уровни провоспалительных цитокинов значительно ниже у носителей G-аллеля, и что уровни кортизола в ответ на стресс ниже у женщин с G-аллелем. аллель. Это открытие очень интересно, потому что стрессовая реакция кортизола и воспалительная система активируются при суицидальном поведении. Более того, аллель G был связан с большей чувствительностью к социальному отторжению, более высоким риском депрессивных эпизодов после социального отторжения. На основании этих открытий можно предположить, что носители аллеля G более чувствительны к социальным взаимодействиям, независимо от их валентности (отторжение или поддержка). Следовательно, они могут быть более склонны к развитию социальной поддержки, защитного фактора против суицидального поведения. В данной работе показано, что генотипы AA/AG полиморфизма A118G были достоверно связаны с суицидной депрессией, возможно что генотип GG может быть защитным фактором при суицидальной депрессии.

 3.    «Влияет ли витамин D на связь между полиморфизмом FTO rs9939609 и депрессией?»

Журнал: Expert Review of Endocrinology and Metabolism (IF=2.82, Q3)

Ссылка: https://doi.org/10.1080/17446651.2021.1889367

Депрессия — широко распространенное и многофакторное психологическое расстройство, в патогенезе которого принимают участие ген жировой массы и связанный с ожирением (FTO) и уровень витамина D в сыворотке. В этом поперечном исследовании приняли участие 197 взрослых людей с избыточным весом, у которых анализировали взаимодействия между однонуклеотидным полиморфизмом гена FTO, депрессией и уровнем витамина D. Показано, что носители аллеля А имели более высокий балл депрессии Бека, а модели многомерной регрессии показали положительную связь между А-аллелем полиморфизма rs9939609 FTO и депрессией. Уровень витамина D в сыворотке не влиял на связь между генотипом FTO и депрессией.

Таким образом,  A-аллель полиморфизма FTO rs9939609 может быть связан с депрессией независимо от уровня витамина D.

 4.    «Витамин D и риски депрессии и тревоги: наблюдательный анализ и полногеномное исследование взаимодействия с окружающей средой»

Журнал: Nutrients (IF=5.717, Q1)

Ссылка: https://doi.org/10.3390/nu13103343

Предыдущие исследования позволяют предположить, что витамин D связан с психическими заболеваниями. Основываясь на когорте британского биобанка, авторы рассчитали оценку полигенного риска (PRS) для витамина D на основе данных полногеномного исследования ассоциации (GWAS) для витамина D. Был проведен линейный и логистический регрессионный анализ для оценки ассоциаций уровней витамина D с депрессивными и тревожными чертами. Затем, используя данные об индивидуальном генотипе и фенотипе из британского биобанка, были проведены полногеномные исследования взаимодействия с окружающей средой (GWEIS), чтобы определить потенциальное влияние взаимодействий ген × витамин D на риски депрессии и тревожности. В когорте британского биобанка наблюдалась значимая ассоциация уровня витамина D в крови с депрессивными и тревожными чертами, а также значимая связь витамин D-ССН с депрессией и тревожностью. GWEIS идентифицировал несколько локусов-кандидатов, таких как rs114086183 для состояния депрессии и rs149760119 для состояния тревожности.  

5.    «Депрессия усиливает APOA4 в плазме без изменений липидов и глюкозы в плазме у девочек-подростков, несущих G-аллель APOA4 rs5104»

Журнал: Journal of Molecular Neuroscience (IF=3.444, Q1)

Ссылка: https://doi.org/10.1007/s12031-020-01766-7

Данное исследование направлено на изучение уровней APOA4 в плазме, липидов и глюкозы у подростков с различными генотипами APOA4 rs5104 с депрессией или без нее. Симптомы депрессии были оценены у 631 подростка с помощью опросника депрессии Бека (BDI). Подростки женского пола имели более высокую распространенность депрессии, чем среди мужского пола, только у носителей аллеля G, но не среди гомозигот АА. Факторы риска депрессии и предикторы ее тяжести различались у носителей аллеля G и гомозигот AA. Более низкие уровни глюкозы наблюдались у парней-носителей аллеля G, чем у парней-гомозигот AA, а повышенные уровни триглецеридов у девушек-носителей аллеля G по сравнению с таковыми у девушек-гомозигот AA. Когда принимались во внимание и APOA4 rs5104, и депрессия, субъекты с депрессией имели более высокие уровни APOA4 в плазме, чем подростки без депрессии, только у девушек-носителей аллеля G, но без значимых изменений липидов и глюкозы в плазме. Депрессия увеличивает уровни APOA4 в плазме без изменений липидов и глюкозы в плазме у девушек-подростков, несущих аллель G APOA4 rs5104.

Полученные результаты могут дать новое объяснение противоречивой взаимосвязи между депрессией, APOA4 и уровнями липидов и глюкозы в плазме в литературе.