Научный дайджест: 27 июля - 2 августа

«Вариативность числа генетических копий, способности к познанию и психоз: мета-анализ и изучение наследования»

Ссылка: https://doi.org/10.1038/s41380-020-0820-7

Журнал: Molecular Psychiatry (IF=11.973, Q1)

Данные последних лет демонстрируют, что различия в количестве копий генетических вариантов (CNV) могут быть критичны для риска развития ряда заболеваний. В частности, определенные специфические CNV увеличивают риски развития шизофрении. При этом, предполагается, что могут существовать определенные фенотипические варианты, представляющие собой промежуточную точку между генетикой и болезнью. Эта статья исследует влияние CNV на познание. Авторы провели систематический обзор и мета-анализ литературы, исследующей влияние CNV на общий уровень интеллекта. Было включено десять первичных исследований с общим количеством участников 18 847 человек, и не было найдено никаких доказательств связи с общим уровнем интеллекта. Однако, в новом исследовании семьи с анамнезом психотических расстройств авторы исследовали влияние CNV на конкретные когнитивные способности. Исследовали влияние больших и малых количеств CNV, а также известных, связанных с шизофренией, CNV у пациентов с психотическими расстройствами, их незатронутых родственников и контрольных пациентов (N = 3428) из базы Международного консорциума по психозу и эндофенотипам. Носители специфических ассоциированных с шизофренией CNV показали худшую производительность, чем контрольная группа. Авторы продемонстрировали, что носители ассоциированных с шизофренией CNV имели худшие показатели отдельных интеллектуальных функций в области познания. Результаты показывают, что известные CNVs высокого риска не только связаны с шизофренией и другими нарушениями нейроразвития, но также являются фактором, способствующим нарушениям в когнитивных областях, таких как память и мышление, и действуют как промежуточные биомаркеры риска заболевания.

«Связь между полиморфизмом G1287A траспортера норэпинефрина и и ответом на терапию антидепрессантами при клинической депрессии: мета-анализ»

Ссылка: https://doi.org/10.1038/s41380-020-0820-7

Журнал: Psychiatric Genetics (IF=1.267, Q2-Q3)

Целью исследования было изучение клинической депрессии (большого депрессивного расстройства) в контексте генетических особенностей и предрасположенностей. Шестнадцать статей, в которых изучалась связь между полиморфизмом G1287A и клинической депрессией или ответом на терапию, были идентифицированы. Данные показали, что ген транспортера норэпинефрина (NET) (в частности, rs5569) вовлечён в этиологию заболевания, а также в реакции на терапию антидепрессантами в китайской когороте людей. Примечательно, что один и тот же полиморфизм продемонстрировал связь и с риском развития заболевания, и с эффективностью терапии. Таким образом, он представляет значительный интерес для таргетного персонализированного подбора терапии.

«Полногеномное низкоохватное секвенирование одновременно с обнаружением вариаций количества копий и лежащих в их основе сложных хромосомных перестроек путем систематического картирования точек остановки у пациентов с интеллектуальным дефицитом / задержкой развития»

Ссылка: https://doi.org/10.3389/fgene.2020.00616

Журнал: Frontiers in Genetics (IF=3.789, Q1-Q2)

Простые вариации количества генетических копий (CNV), обнаруженные хромосомным микрочипом, могут быть результатом сложных структурных изменений. Авторы применили комбинирование методик для одновременного выявления патогенных CNV и связанных с ними хромосомных перестроек у 15 пациентов. Технология позволила идентифицировать все 34 патогенные CNV, обнаруженные с помощью микроматрицы. Авторы классифицировали структурные изменения, выявленные у пациентов, на шесть структурных категорий и продемонстрировали способность обнаруживать CNV и определять контрольные точки и их нарушенные гены и окружающие их последовательности в одном эксперименте с разрешением до пары оснований, что помогает больше узнать о механизмах формирования наблюдаемых геномных перестроек и в которых механизмы репликация и репарации ДНК могут способствовать формированию сложных перестроек у пациентов. Кариотипирование на молекулярном уровне остается достаточно сложной задачей, однако, совершенствование метода может помочь обеспечить точную оценку наследуемого риска и уточнить пренатальную диагностику или репродуктивное планирование. 

«Мета-анализ экспрессии генов обнаружил активацию CREB1 и CREBBP в десятом поле Бродмана у пациентов с шизофренией»

Ссылка: https://doi.org/10.1016/j.psychres.2020.113311

Журнал: Psychiatry Research (IF= 2.208, Q1-Q3)

Для пациентов с шизофренией часто характерны те или иные когнитивные нарушения, связанные с функциональным исходом. Транскрипционный фактор гена CREB1, как и связанные с ним белки (CREB1 и оба CREB-связывающих белка (CREBBP) и E1A-связывающий белок P300 (EP300), коактиваторы CREB1), играет важную роль в процессах обучения и памяти и связаны с шизофренией. Авторы выполнили систематический мета-анализ дифференциальной экспрессии CREB1, CREBBP и EP300 для пациентов с шизофренией и в сравнении со здоровыми. Были проанализированы в общей сложности данные по 41 образцу шизофрении и 38 контрольных групп. Была обнаружена повышенная экспрессия CREB1 и CREBBP в образцах десятого поля Бродмана у пациентов с шизофренией, тогда как экспрессия EP300 не была дифференциально выражена в разных группах. Интеграция двух независимых наборов данных и положительная корреляция между паттернами экспрессии CREB1 и CREBBP повышают достоверность результатов. Повышенная регуляция CREB1 и его ко-активатора CREBBP может быть связана с измененной активацией десятого поля Бродмана, которая была показана при шизофрении. Это предполагает участие CREB1 и CREBBP в когнитивных симптомах, характеризующих заболевание. 

 «Отсутствие связи между генетическим изменением pla2g6 и болезнью Паркинсона: систематический обзор»

Ссылка: https://doi.org/10.2147/NDT.S254065

Журнал: Neuropsychiatric Disease and Treatment (IF= 2.228, Q1)

Ген фосфолипазы A2 группы 6 (PLA2G6, также известный как PLA2, PARK14 и iPLA2) кодирует кальций-независимую фосфолипазу A2 группы VIA. Генетический полиморфизм PLA2G6 участвует в формировании восприимчивости к болезни Паркинсона (БП), однако связь не до конца ясна.  Были включены 8 исследований, соответствовавших критериям включения, с 2779 пациентами и 3291 контрольным участником, в которых изучалась связь полиморфизмов PLA2G6 с риском развития болезни Паркинсона. Из всех 27 зарегистрированных генетических вариантов 15 однонуклеотидных полиморфизмов (SNP) присутствовавших только у пациентов, только пять доступных SNP (rs2267369, rs140758033, c.1959T> A (Gly653Gly), rs76718524, rs199935023) были объединены в мета-анализ. Тем не менее, не было найдено доказательств существенной связи между пятью SNPs и риском болезни Паркинсона ни в одной из исследуемых моделей наследования (доминантной, кодоминантной и аллельной), что свидетельствует об отсутствии связи между генетической вариабельностью PLA2G6 и восприимчивостью к заболеванию