Научный дайджест: 28 июня - 4 июля

1) «Влияние однонуклеотидных полиморфизмов NOD2 или CD14 на риск заболеваний, связанных с Mycobacterium tuberculosis: систематический обзор»

Журнал: Systematic Reviews (IF=2.21, Q1)

Ссылка: https://doi.org/10.1186/s13643-021-01729-y

Туберкулез (ТБ) по-прежнему является одной из основных причин смерти во всем мире. Генетические исследования показали актуальность исследования полиморфных аллелей NOD2 и CD14 в связи с риском заболеваний, вызываемых инфекцией Mycobacterium tuberculosis. Авторы выполнили поиск публикаций в базах PubMed, EMBASE, Scientific Electronic Library Online (SciELO) и Literatura Latino-Americana e do Caribe em Ciências da Saúde (Lilacs). Критериям отбора соответствовали тринадцать исследований. В 9 публикациях была показана значимая ассоциация между аллелем T и генотипами TT SNP rs2569190 и повышенным риском заболеваний ТБ, а генотип CC rs2569191 был ассоциирован с защитой от ТБ. В исследованиях NOD2 показаны ассоциации 2 SNP с повышенным риском ТБ в китайской популяции, и еще 2 SNP с низким риском ТБ у афроамериканцев. 

Влияние полиморфизмов CD14 на риск заболевания ТБ и значимая ассоциация SNP NOD2 для определенных этносов подчеркивает актуальность генетического тестирования в оценке риска. 

2) «Функциональный полиморфизм гена NFE2L2, связан с чувствительностью к туберкулезу»

Журнал: Frontiers in Immunology (IF=6.429, Q1)

Ссылка: https://doi.org/10.3389/fimmu.2021.660384

Ядерный фактор транскрипции эритроид 2, связанный с p45 фактор 2 (Nrf2), кодируемый геном NFE2L2, функционирует как ключевой фактор транскрипции и регулирует экспрессию антиоксидантных генов. Данное исследование было направлено на изучение связи однонуклеотидных полиморфизмов NFE2L2 с туберкулезом и латентной туберкулезной инфекцией (ЛТБ). В исследование включены 1950 человек из популяции Хань (Китай), у которых генотипировано пять полиморфизмов. Обнаружена ассоциация 2 SNP (rs13005431 и rs2364723) с повышенной чувствительностью к ТБ, один из SNP (rs6726395) показал различия между группами с активным и латентным ТБ, и еще у одного гаплотипов двух SNP были показаны различия по частоте встречаемости между группами ТБ и здоровых субъектов. Исследования по биологической активности с использованием плазмид, кодирующих полиморфные промоторы (rs13005431), показали различия в уровне активности.

Полученные данные помимо статистических различий по генетическим характеристикам, показали один из возможных вариантов влияния на предрасположенность к ТБ путем подавления транскрипционной активности NFE2L2. 

3) «Секвенирование нового поколения комбинированное с общегеномным ассоциативным исследованием выявляет новые локусы чувствительности к туберкулезу в китайской популяции»

Журнал: Genomics (IF=6.205, Q1)

Ссылка: https://doi.org/10.1016/j.ygeno.2021.05.035

Широко признаны генетические факторы предрасположенности к туберкулезу, которые, однако, требуют дополнительных исследований в каждом этносе. В статье представлены результаты двухэтапного исследования с участием 616 больных туберкулезом и 709 здоровых людей из контрольной группы для систематического выявления генетических маркеров предрасположенности к туберкулезу. На этапе открытия было идентифицировано 93 однонуклеотидных полиморфизма и 3 аллеля системы HLA класса II, которые потенциально связаны с чувствительностью к туберкулезу. На этапе проверки подтвердили, что 6 номинально значимых SNP, включая 2 новых варианта миссенс в RAB17 и DCTN4, ассоциированы с предрасположенностью к туберкулезу. Более того, впервые показано, что аллель HLA-II DQA1*05:05 также является локусом чувствительности к ТБ. 

Такое полноразмерное исследование позволило оценить и выявить большое количество генетических вариантов, а также внесло новый вклад в представление о патогенезе туберкулеза

4) «Изучение ассоциации полиморфизмов гена интерферона-γ и баланса Th1/Th2 и чувствительности к туберкулезу»

Журнал: American Journal of Translational Research (IF=3.378, Q1)

Ссылка: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34150154/

В данном исследовании изучали связь полиморфизмов гена интерферона-γ (IFN-γ) и баланса Th1/Th2 с предрасположенностью к ТБ. В исследовании приняли участие 121 больной ТБ и 80 здоровых лиц. Разница в распределении частот встречаемости генотипов полиморфизма IFN-γ (+874 T / A) между двумя группами субъектов была статистически значимой. Различия между группами также обнаружены при оценке содержания Th1, и соотношения Th1/Th2, которое было значимо нижу к больных ТБ. Кроме того, соотношение Th1/Th2 у больных туберкулезом с генотипом AA IFN-γ (+874 T / A) было значимо ниже, чем у пациентов с генотипом AT + TT.

Авторы делают предположение, что генотип AA гена IFN-γ (+874 T / A) является признаком чувствительности к туберкулезу. Этот механизм может быть связан с дисбалансом Th1/Th2, который чаще встречается у пациентов с генотипом AA, и который может привести к снижению иммунных функций организма, что делает его более восприимчивым к заражению микобактериями, вызывающими туберкулез. 

5) «Ассоциация полиморфизма генов IL-4 и IL-6 с туберкулезом легких»

Журнал: European Journal of Molecular and Clinical Medicine (IF=8.11, Q1)

Ссылка: https://10.31838/ejmcm.07.02.11

Исследование случай-контроль было проведено на жителях провинции Бабиль (Ирак). Была обнаружена ассоциация генотипов и аллелей IL-4 rs2243250 (C/C, C/T, T/T) с ТБ. Аллель C описан как фактор риска для пациентов с ТБ, в то время как аллель Т представляет собой защитный аллель для контрольной группы. Связь генотипов IL-6 rs1800796 (C/C, G/C, G/G) была значимой для случаев ТБЛ, тогда как разница в частоте встречаемости аллелей была незначительной. При этом между группами с ТБ и контрольной группой наблюдалась значимая разница в среднем уровне концентрации как IL-4, так и IL-6 в сыворотке крови. Влияние генотипов на уровень цитокинов в сыворотке было незначительным.

Полученные данные, описывают генетические характеристики факторов риска заболевания ТБ, и подчеркивают необходимость этнических исследований.