Научный дайджест: 15-21 июня

Могут ли одни и те же полиморфизмы быть значимы в одной этнической группе и не значимы в другой?

«Полиморфизмы APOC3rs2854116, PNPLA3rs738409 и TM6SF2rs58542926 могут влиять на предрасположенность к НАЖБП: мета-анализ»

Ссылка: https://doi.org/10.1002/iub.2302 

Журнал: IUBMB Life (IF=3.09, Q2)

Неалкогольная жировая болезнь печени (НАЖБП) является одним из наиболее распространенных хронических заболеваний печени во всем мире. Она поражает 25-30% населения. НАЖБП считается многофакторным заболеванием, и, хотя конкретные механизмы патогенеза все еще не выявлены, накапливается всё больше свидетельств того, что наследственные факторы участвуют в его развитии. При этом, случаи НАЖБП среди различных этнических групп разнятся, и генетический фон считается одним из факторов, способствующих этому явлению. Однако, конкретные механизмы и генетические риски предрасположенности до сих пор не выявлены. Авторы описывают проведенный анализ на данных 49 исследований по оценке связи 4 полиморфизмов с риском развития НАЖБП: APOC3 rs2854117 (994 случая и 966 человека в контрольной группе суммарно), APOC3 rs2854116 (1370 и 1764, соответственно), PNPLA3 rs738409 (7467 и 12352) и TM6SF2 rs58542926 (2889 и 2561). Для каждого полиморфизма оценивался его вклад в формирование рисков развития в общей популяции, а также, если это было возможно, отдельно для азиатской и европеоидной подгрупп. PNPLA3 rs738409 и TM6SF2 rs58542926 продемонстрировали статистическую значимость для общей когорты, а также для обеих исследуемых групп, в том время как для APOC3 rs2854117 не было выявлено статистической значимости, а для APOC3 rs2854116 – только в общей группе, но не в подгруппах. Авторы делают вывод о возможной значимости исследуемых полиморфизмов для развития НАЖБП и необходимости дальнейшего их исследования в качестве потенциальных терапевтических мишеней.

Есть ли связи между преобладанием определенных генетических вариантов риска развития заболеваний и этническими особенностями?

«Общие полиморфизмы в генах MC4R и FTO связаны с ИМТ и метаболическими показателями у мексиканских детей: различия по полу и генетическому происхождению»

Ссылка: https://doi.org/10.1016/j.gene.2020.144840

Журнал: Gene (IF=3.33, Q1-Q2)

Для ряда полиморфизмов в генах MC4R, LEP, LEPR и FTO показаны ассоциации с риском ожирения и метаболических расстройств, различающиеся в зависимости от этнического и генетического происхождения. Однако, в Мексике высокая частота смешанных браков, в результате чего происходит перекрестное влияние и наложение генетических рисков. Авторы описывают результаты исследования ассоциаций между генетическими особенностями и фенотипическими проявлениями у 718 не родственных мексиканских школьников. Высокие триглицериды и низкий уровень холестерина ЛПВП были наиболее частыми метаболическими изменениями среди школьников, при этом были установлены связанные с полом различия по взаимосвязям генотип-фенотип между группами с разным генетическими происхождением. Полиморфизмы в генах FTO (rs8050136, rs9939609) и MC4R (rs17782313) были в значительной степени связаны с ожирением у мальчиков, а также (только для FTO) – c более высокими уровнями триглицеридов. Авторы делают вывод о более высокой распространенности аллелей риска в генах FTO и MC4R у детей с европеоидным генетическим происхождением по сравнению с потомками американских индейцев. 

Проводят ли новые исследования по подтверждению значимости отдельных полиморфизмов в разных этнических группах?

«Роль однонуклеотидного полиморфизма +62 G>A в экспрессии гена резистина, влияющего на уровень резистина в сыворотке крови при метаболическом синдроме в египетской популяции»

Ссылка: https://doi.org 10.2174/1389201021666191210122851

Журнал: Current Pharmaceutical Biotechnology (IF=1.49, Q2-Q3)

Существует гипотеза, что резистин является связующим звеном между ожирением, воспалением и диабетом второго типа. Авторы описывают результаты исследования, направленного на изучение того, связан ли полиморфизм гена резистина (RETN) (+ 62G> A, rs3745368) с риском развития метаболического синдрома и сывороточным уровнем резистина в египетской популяции. Исследование было проведено с участием 310 египетских добровольцев: 160 пациентов с метаболическим синдромом и 150 контрольных. Определялись антропометрические параметры и биохимические данные. Полиморфизм в rs3745368 был ассоциирован с более высокими уровнями резистина и риском развития метаболического синдрома в египетской популяции.

Влияет ли развитие ожирения на эпигенетическую регуляцию или наоборот?

«Эпигенетическая регуляция белой жировой ткани на ранних этапах ожирения и метаболических заболеваний»

Ссылка: https://doi.org/10.1111/obr.13054 

Журнал: Obesity Reviews (IF=8.48, Q1)

Ожирение и метаболический синдром являются одними из наиболее распространенных проблем со здоровьем в развитых странах. Нарушение функции жировой ткани частично является причиной этиологии этих состояний. Эпигенетические механизмы позволяют регулировать экспрессию генов, уплотнение хроматина и репарацию ДНК; таким образом, эпигенетика может адаптировать клеточный ответ к условиям окружающей среды. Авторы описывают роль эпигенетических механизмов в возникновении ожирения и связанных с ним нарушений обмена веществ, уделяя особое внимание функционированию жировой ткани, и подчеркивают важность поступления питательных веществ и образа жизни в регуляции эпигенетических механизмов и как они могут влиять на пластичность жировой ткани и ее функционирование при ожирении и метаболических заболеваниях. Эпигенетический ландшафт становится тонко регулируемым регулятором клеточных реакций в соответствии с энергетическими, метаболическими и физиологическими условиями клетки. Изменения в метаболических путях, нерегулируемых при ожирении и метаболическом синдроме, могут частично объяснить нарушения эпигенетических меток в жировой ткани при этих нарушениях. Понимание того, как эта эпигенетическая дезрегуляция может влиять на биологию и функцию жировой ткани, может привести к разработке новых терапевтических подходов, основанных на эпигенетических стратегиях.

Существуют ли предсказательные модели развития заболевания, основанные на крупных генетико-эпидемиологических исследованиях в пределах одной популяции?

«Подтверждение дважды взвешенного показателя генетического риска для прогнозирования диабета 2 типа в когортах Lifelines и «Эстонский биобанк»»

Ссылка: https://doi.org/10.1002/gepi.22327 

Журнал: Genetic Epidemiology (IF=2.54, Q1)

Поскольку многие случаи диабета 2 типа (СД2), вероятно, остаются не диагностированными, для предотвращения или отсрочки заболевания необходимы более эффективные инструменты для раннего выявления лиц с высоким риском. Авторы исследовали значение дважды взвешенного показателя генетического риска (dwGRS) для прогнозирования развития СД2. DwGRS использует дополнительный вес для каждого единичного нуклеотидного полиморфизма в балле риска, чтобы скорректировать смещение «проклятия победителя» в оценках величины эффекта. Традиционный (единичный взвешенный генетический риск; swGRS) и dwGRS были рассчитаны для участников в Lifelines (n = 12,018) и Эстонский биобанк (n = 34,129). Было обнаружено, что dwGRS имеет более сильную связь с развитием СД2 по сравнению с swGRS. Сравнивая прогнозируемые на 5 лет риски с моделями с и без dwGRS, авторы получили значимые различия, которые показали, что используемый подход позволяет с большей точностью прогнозировать развитие СД2 как с установленными фенотипическими предикторами, так и без них. Авторы резюмируют, что показатель генетического риска можно рассматривать как долгосрочный предиктор, в отличие от фенотипических факторов риска, которые могут стать прогностическими только в относительно короткий период времени до начала заболевания.