Научный дайджест: 5-11 апреля

1.    «Однонуклеотидный полиморфизм генов, связанных с окислительным стрессом, и риск инсульта в польской популяции —предварительное исследование»

Журнал: Brain Sciences (IF =17.33, Q1)

Ссылка: https://doi.org/10.3390/brainsci11030391

Данное исследование случай-контроль было предпринято для выявления потенциальной ассоциации шести однонуклеотидных полиморфизмов (SNP) в генах, связанных с окислительным стрессом: SOD2 (c.47T> C; rs4880), CAT (c.-89A> T; rs7943316), GPX4 (c.660T> A; rs713041), NOS1 (g.117803515C> T; rs1879417) и NOS2 (c.1823C> T; rs2297518 и c.-227G> C; rs10459953) и риском возникновения инсульта. SNP были определены с помощью теста TaqMan® Allelic Discrimination Assay у 107 пациентов с инсультом и 107 лиц того же возраста и пола, у которых не было нарушений мозгового кровообращения. Аллель T rs4880 положительно коррелировал с инсультом (OR 1,31; 1,07–1,59 95% CI). В случае rs713041 была обнаружена ассоциация инсульта с аллелем Т (OR 1,36; 1,12–1,67 95% СI). Кроме того, возникновение инсульта было связано с наличием аллеля C rs1879417 (OR 1,32; 1,09–1,61 95% СI). Также было обнаружено, что генотип C/C и аллель C rs2297518 увеличивают риск инсульта (OR 7,00; 4,34-11,29 и 4,96; 3,88-6,34 соответственно). Более того, аллель C rs10459953 был связан с повышенной частотой этого заболевания (OR 1,31; 1,08–1,60 95% СI). Эти результаты показали, что генетические варианты SOD2, GPX4, NOS1 и NOS2 могут быть связаны с предрасположенностью к инсультам в польской популяции.  

2.    «Полиморфизм 3’-utr в гене тимидилатсинтазы (TS), связанный с риском ишемического инсульта и тихого инфаркта мозга»

Журнал: Journal of Personalized Medicine (IF =1.010, Q1)

Ссылка: https://doi.org/10.3390/jpm11030200

Тимидилатсинтаза (TS) — ключевой ген, участвующий в восстановлении повреждений ДНК и синтезе ДНК, играет важную роль в развитии и восстановлении сосудов. В частности, полиморфизмы генов TS играютактивно участвуют в прогрессировании сосудистых заболеваний и метастазов рака. Таким образом, целью данного исследования было изучить связь трех полиморфизмов TS (1100T> C [rs699517], 1170A> G [rs2790] и 1494ins/del [rs151264360]) с ишемическим инсультом и тихим инфарктом головного мозга (ТИМ). В исследовании приняли участие 1299 участников (507 пациентов с инсультом, 383 пациента ТИМ и 409 человек из контрольной группы). Генотипирование трех полиморфизмов TS выполняли с помощью анализа ПЦР. Чтобы изучить связь между полиморфизмом генов TS и заболеваниями, авторы провели статистический анализ, включая многомерную логистическую регрессию и точные тесты Фишера. Было обнаружено, что генотипы TS 1100T> C и 1170A> G были значимо ассоциированы с ишемическим инсультом и чувствительностью к ТИМ. А именно: полиморфизм TS 1100T> C был ассоциирован с вероятностью ишемического инсульта (TT против CC: OR = 2,151, 95% CI = 1,275-3,628, P = 0,004) и ТИМ (TT против TC + CC: OR = 1,443, 95% CI = 1,009–2,063, P = 0,045). Напротив, полиморфизм TS 1170A> G показал корреляцию с низким риском инсульта (AA против GG: OR = 0,284, 95% CI = 0,151–0,537, P <0,0001) и ТИМ (AA против GG: OR = 0,070, 95% CI = 0,016–0,298, P = 0,0002). Кроме того, авторы подтвердили, что полиморфизм TS 1100T> C был синергетическим с низким уровнем фолиевой кислоты (OR = 6,749, P <0,0001). В целом эти результаты предполагают, что полиморфизмы TS 1100T> C и 1170A> G связаны с риском ишемического инсульта и ТИМ, и выполненное исследование предоставляет первое доказательство того, что варианты 3'-UTR в TS являются потенциальными биомаркерами при ишемическом инсульте и ТИМ.  

3.    «Влияет ли полиморфизм CYP2C19 на неврологическое ухудшение у пациентов с инсультом/ТИА? Систематический обзор и метаанализ проспективных когортных исследований»

Журнал: Medicine (IF =1.552, Q2)

Ссылка: https://doi.org/10.1097/MD.0000000000025150

Связь между полиморфизмом цитохрома P450 2C19 (CYP2C19) и неврологическим ухудшением у пациентов с инсультом или транзиторной ишемической атакой (ТИА) до конца не изучена. Поэтому авторы провели систематический обзор и метаанализ проспективных когортных исследований, чтобы количественно оценить эту ассоциацию. Был проведен поиск исследований, опубликованных до апреля 2019 г. в PubMed, Кокрановской библиотеке, базе данных Excerpta Medica, в базах данных China National Knowledge Infrastructure и WanFang. Были включены проспективные когортные исследования, в которых сообщалось о связи между полиморфизмами CYP2C19 и неврологическим ухудшением у пациентов с инсультом/ТИА. Авторы извлекли и объединили данные о соотношении рисков (ОR) и 95% доверительных интервалах (СI). В исследование было включено 19 подходящих работ. В двенадцати исследованиях сообщалось об аллелях потери функции CYP2C19∗2, ∗3, а в 5 исследованиях сообщалось об аллеле увеличения функции CYP2C19∗17. По сравнению с не носителями, носители аллелей потери функции CYP2C19∗2, ∗3 имели значительно более высокий риск неврологического ухудшения (OR 1,63; 95% CI 1,32–2,02). Напротив, носители аллеля усиления функции CYP2C19∗17 имели значительно более низкий риск неврологического ухудшения (OR 0,520; 95% CI 0,393–0,689) по сравнению с не носителями. Таким образом, этот метаанализ продемонстрировал, что носители аллелей потери функции CYP2C19∗2, ∗3 имеют повышенный риск неврологического ухудшения по сравнению с не носителями у пациентов с инсультом или ТИА, а аллель усиления функции CYP2C19∗17 может снизить риск неврологического ухудшения.  

4.    «Связь между генетическими вариантами днРНК ANRIL с предрасположенностью к ишемическому инсульту: от исследования случай-контроль к метаанализу»

Журнал: Medicine (IF =1.552, Q2)

Ссылка: https://doi.org/10.1097/MD.0000000000025113

Недавние исследования показали, что антисмысловая некодирующая РНК днРНК (длинная некодирующая РНК) в локусе INK4 (ANRIL) играет важную роль в развитии атеросклероза через регуляцию апоптоза, пролиферации и адгезии клеток. GWAS (исследования полногеномных ассоциации) выявил общие генетические варианты в ANRIL, которые могут формировать риск ишемического инсульта (ИИ) в южной Швеции. В данной работе было проведено исследование случай-контроль с участием 567 пациентов с ИИ и 552 здоровых людей из контрольной группы с целью изучить связь между полиморфизмами днРНК ANRIL rs2383207, rs4977574 и риском ИИ. И далее был проведен метаанализ для дальнейшей оценки взаимосвязи этих вариантов и заболевания. В данном исследовании случай-контроль во всех моделях не наблюдалось значимых ассоциаций между более чем двумя полиморфизмами и ИИ. Однако при анализе подгрупп была обнаружена значимая ассоциация между генотипом GA rs4977574 и повышенным риском атеросклеротического ишемического инсульта крупной артерии, аналогичный повышенный риск также появился в генотипе GG + GA в доминантной модели (P = 0,048, OR = 1,385, 95% CI 1,002–1,914; P = 0,040, OR = 1,378, 95% CI 1,015–1,872 соответственно). Что касается rs2383207, отрицательные результаты были получены по всем моделям и подгруппам. Выполненный метаанализ показал значимую ассоциацию  между полиморфизмом rs4977574 и риском ИИ в аллельной модели (G vs A P = 0,002, OR = 1,137, 95% CI 1,048–1,234); Что касается полиморфизма rs2383207, не было обнаружено значимой связи между этим SNP и риском ИИ в доминантной модели (GA + AA против GG, P = 0,061, OR = 0,923, 95% CI 0,849-1,004) или рецессивной модели (AA против GA + GG, P = 0,656, OR = 0,972, 95% CI 0,858–1,101) или аллельной модели (A vs G, P = 0,326, OR = 0,952, 95% CI 0,863–1,050). Полученные результаты показали, что аллель G днРНК ANRIL rs4977574 может увеличивать риск ИИ, и этот вариант может быть связан с предрасположенностью к ИИ в китайской популяции.  

5.    «Варианты Htra1 и взаимодействие с курением обусловливают генетическую предрасположенность к ишемическому инсульту»

Журнал: International Journal of Medical Sciences (IF =2.399, Q1)

Ссылка: https://doi.org/10.7150/ijms.45856

Белок A1 (HtrA1), был идентифицирован как ген, вызывающий аутосомно-рецессивную артериопатию и ассоциирован с лакунарным ишемическим инсультом (ИИ) в Европе. Это исследование, направленное на оценку ассоциации HTRA1 с ишемическим инсультом (ИИ), и четыре маркированных однонуклеотидных полиморфизма (SNP) были генотипированы в когорте из 4098 китайцев. Был измерен уровень мРНК HTRA1 в 72 случаях ИИ и 72 субъектов контроля с артериальной гипертензией. В целом по популяции SNP rs2268350 (C> T) был достоверно связан с частотой ИИ (P = 0,034). Стратификационный анализ выявил значимую ассоциацию rs2268350 у мужчин, курящих и пьющих, rs2672587 (C> G) у курящих и некурящих и rs3793917 (C> G) у курящих, некурящих и непьющих подгрупп с инсультом (P <0,05). Аддитивное взаимодействие и мультипликативное взаимодействие между rs2268350 и курением было значимым (P <0,05) после корректировки ковариант. Среди генотипов rs3793917 (P = 0,009) и rs2672587 (P = 0,047) в популяции курящих субъектов наблюдался совокупный риск ИИ. Уровень мРНК HTRA1 у некурящих носителей генотипа СС rs2268350был значимо выше, чем у курильщиков с rs2268350 CT/TT (P = 0,046) в случаях ИИ. Полученные результаты подтверждают, что полиморфизмы гена HTRA1 вносят вклад в генетическую предрасположенность к ИИ, а курение может изменять генетический эффект HTRA1 на ИИ, подавляя экспрессию мРНК HTRA1.