Научный дайджест: нарушения в нервной системе
global.5p1. «Обзор и метаанализ профилей экспрессии генов при самоубийстве»
Журнал: European Neuropsychopharmacology (IF=4.6, Q1)
Ссылка: https://doi.org/10.1016/j.euroneuro.2021.12.003
В результате самоубийств во всем мире погибло более 800 000 человек, что делает это серьезной проблемой для общественного здравоохранения.
Этиопатофизиология самоубийства остается неясной и очень сложной, а посмертные исследования экспрессии генов могут предложить понимание молекулярно-биологического механизма, лежащего в основе самоубийства.
Авторы отобрали пять наборов данных экспрессии генов для посмертных образцов орбитофронтальных, префронтальных или дорсолатеральных префронтальных кортикальных областей мозга из репозитория Gene Expression Omnibus. После контроля качества общий размер выборки составил 380 образцов (141 самоубийство и 239 смертей от других причин).
Анализ был выполнен с использованием двух метааналитических подходов, и дополнительно проанализированы пути и обогащения. Была обнаружена сниженная экспрессия генов KCNJ2, A2M (альфа-2-макроглобулин), AGT (ангиотензиноген), PMP2 (периферический миелиновый белок 2) и VEZF1 (эндотелиальный цинковый фактор сосудов 1).
Полученные результаты подтверждают участие астроцитов, реакции на стресс, иммунной системы и микроглии в самоубийстве. Эти результаты предполагают дальнейшую проверку на дополнительных больших наборах данных.
2. «Влияние полиморфизма генов нейротрофических факторов мозга на двигательную активность и двигательное обучение: систематический обзор и метаанализ»
Журнал: Behavioural Brain Research (IF=3.332, Q1)
Ссылка: https://doi.org/10.1016/j.bbr.2021.113712
Полиморфизм гена нейротрофического фактора головного мозга (BDNF) может модулировать эффективность нейротрансмиттера, тем самым влиять на двигательную активность и двигательное обучение.
Всего с помощью поиска в базах данных PubMed и Web of Science было выявлено 19 релевантных исследований, опубликованных в период с 2000 по 2021 год, с анализом двигательной активности или моторного обучения в качестве основных критериев оценки.
Результаты показали, что генотип BDNF вряд ли будет оказывать эффект на двигательную деятельность и способность к двигательному обучению, потому что только 2/32 набора данных (6,3%) из 16 исследований по двигательной деятельности и 3/19 наборов данных (17,6%) из 13 исследований на моторное обучение указывают на значимый генетический эффект. Более того, метаанализ публикаций по моторному обучению с участием 17 наборов данных из 11 исследований показал, что не было статистической разницы в оценке обучения, нормализованной с использованием исходных данных, между носителями Val/Val и Met (Val/Met + Met/Met или Val/Met.
Таким образом, видимо генотип BDNF может иметь лишь незначительное влияние на индивидуальные двигательные характеристики и способности к двигательному обучению.
3. «Полиморфизм гена AURKA и предрасположенность к опухолям центральной нервной системы у детей Китая»
Журнал: Discover Oncology (IF=3.869, Q1)
Ссылка: https://doi.org/10.1007/s12672-021-00459-w
Опухоли центральной нервной системы (ЦНС) составляют 15–20% всех злокачественных новообразований, возникающих в детском и подростковом возрасте.
Предыдущие исследования показали, что сверхэкспрессия и амплификация гена AURKA могут вызывать множественные злокачественные новообразования человека, однако ассоциация с опухолями в ЦНС не была широко изучена.
В этом исследовании случай–контроль (191 пациент с опухолью ЦНС и 248 контроль) обнаружено, что полиморфизм гена AURKA rs8173 G>C показал решающую функцию в снижении предрасположенности к опухоли ЦНС. Кроме того, комбинированный эффект снижения риска развития опухолей ЦНС был более выражен у носителей с 3 защитными генотипами, чем у других.
Дальнейший стратификационный анализ подтвердил, что наличие rs8173 GC / CC и трех защитных генотипов снижает риск опухоли ЦНС в некоторых подгруппах.
Данное исследование показало, что ген rs8173 G>C AURKA значимо ассоциирован с предрасположенностью к опухолям ЦНС у китайских детей. Необходимы дополнительные функциональные эксперименты и проверка гипотезы на других расах.
4. «Изучение эндолизосомальной системы при основных нейрокогнитивных расстройствах, вызванных болезнью Альцгеймера, лобно-височной долевой дегенерацией и болезнью тельца: данные о том, что SORL1 является перекрестным геном»
Журнал: International Journal of Molecular Sciences (IF=5.923, Q1)
Ссылка: https://doi.org/10.3390/ijms222413633
Предполагается, что дисфункции в эндолизосомной системе лежат в основе нейродегенерации при основных нейрокогнитивных расстройствах, вызванных болезнью Альцгеймера (AD), лобно-височной долевой дегенерацией (FTLD) и болезнью с тельцами Леви (DLB).
Цель этого исследования — выяснить, имеют ли эти заболевания генетическую изменчивость в эндолизосомном пути.
У пациентов с AD, DLB и FTLD и в контрольной группе (948 субъектов) было выполнено целевое секвенирование 50 основных генов, принадлежащих к эндолизосомному пути.
Генетический анализ выявил четыре полиморфизма ранее описанных, как связанные с неврологическими заболеванием, в генах SORL1 (p.N1246K, p.N371T, p.D2065V) и DNAJC6 (p.M133L) при AD, FTLD и DLB.
Также обнаружено три нулевых варианта у пациентов с AD в генах SORL1 (p.R985X в семейной AD с ранним началом, p.R1207X) и PPT1 (p.R48X в семейной AD с ранним началом), где потеря функции является известным механизмом заболевания. Анализ одного варианта и генной нагрузки выявил некоторые номинально значимые результаты, представляющие потенциальный интерес для генов SORL1 и DNAJC6.
Полученные данные подчеркивают, что гены, контролирующие ключевые эндолизосомные процессы (например, сортировку/транспорт белков, снятие оболочки с клатриновых везикул, регуляция лизосомальной ферментативной активности), могут быть вовлечены в патогенез AD, FTLD и DLB, что указывает на этиологическую связь этих заболеваний.
5. «Полиморфизм генов рецепторов витамина D и риск болезни Альцгеймера и легких когнитивных нарушений: систематический обзор и метаанализ»
Журнал: Advances in Nutrition (IF=8.701, Q1)
Ссылка: https://doi.org/10.1093/advances/nmab074
Результаты эпидемиологических исследований показывают, что полиморфизм гена рецептора витамина D (VDR) потенциально связаны с болезнью Альцгеймера (AD) и легкими когнитивными нарушениями (MCI), но эта ассоциация часто неоднозначна.
Авторы выполнили мета анализ с поиском в базах данных PubMed, Embase, Cochrane Library и China National Knowledge Infrastructure и отбором 10 исследований, включающих 3573 участников.
Выполненный анализ показал ассоциацию между полиморфизмом BsmI и повышенными шансами MCI в аллельной, доминантной и гетерозиготной модели. Напротив, полиморфизм ApaI показал защитный эффект от MCI во всех моделях. В доминантной и гомозиготной модели показана ассоциация между полиморфизмом TaqI гена VDR и повышенной вероятностью AD, особенно у лиц европеоидной расы. Тест линейной регрессии не обнаружил систематической ошибки публикации.
Этот метаанализ показал, что полиморфизмы генов VDR ApaI, BsmI и TaqI могут быть важными предикторами MCI и AD. Для дальнейшего подтверждения этих ассоциаций необходимы дополнительные исследования с учетом взаимодействий генов, взаимодействий генов и окружающей среды и других факторов.