Научный дайджест: 11-17 января

1.    «Полиморфизм фактора ингибирования миграции макрофагов-794 CATT5-8 и чувствительность к туберкулезу»

Журнал: Infection (IF = 2.927, Q1)

Ссылка: https://doi.org/10.1007/s15010-020-01562-w

Определение возможных генетических детерминант, связанных с туберкулезом, является сложной задачей, учитывая различия в частотах среди популяций. Целью данного исследования было оценить связь между полиморфизмом MIF - 794 CATT 5-8 и предрасположенностью к туберкулезом. Исследование проводилось методом анализа случай–контроль. В группу пациентов были включены больные туберкулезом легких (ТБЛ) 18 лет, контрольную группу составили доноры крови и здоровые контактные люди 18 лет. Полиморфизмы MIF - 794 CATT 5-8 был генотипированы с использованием ПЦР и капиллярного электрофореза. Итого, в исследование было включено 126 пациентов и 119 контрольных субъектов. Генотип 5/5 чаще встречался среди случаев ТБЛ (15,1%), чем среди контрольной группы (5,9%) (p = 0,019). Пациенты чаще имели аллель 5 (29,4%) по сравнению с контролем (19,3%) (p = 0,010). Распространенность генотипов 7/X + 8/X не различалась между случаями и контролем (p = 0,821). Не было различий между пациентами с аллелями 7 и 8 и пациентами с аллелями 5 и 6 (p = 0,608). Таким образом, авторы предполагают, участие генотипа 5/5 и аллеля 5 гена MIF-794 CATT 5-8 в чувствительности к туберкулезу легких.

2.    «Изучение роли единичного нуклеотидного полиморфизма CC хемокинового лиганда-2 в туберкулезе легких: исследование генетической ассоциации в Северной Индии»

Журнал: Journal of Immunology Research (IF = 3.327, Q1)

Ссылка: https://doi.org/10.1155/2020/1019639

Доказано, что хемокиновый лиганд-2 (CCL2) с мотивом C-C связан с предрасположенностью к туберкулезу у некоторых этнических групп. В настоящем исследовании была предпринята попытка выяснить связь вариантов CCL2-2518 A>G и -362 G C с чувствительностью к туберкулезу в популяции из Северной Индии. Генотипирование было проведено у 373 участников с легочным туберкулезом (ТБЛ) и 248 здоровых контролей (ЗД) на полиморфизмы CCL2-2518 A>G и -362 G>C с помощью ПЦР-ПДРФ и анализа кривой плавления с использованием метода FRET. Частоты генотипов и аллелей сравнивали с помощью критерия хи-квадрат и отношения шансов (OR) и отношения шансов Мантеля-Хензеля (M-H), расчет проводили с помощью программного обеспечения STATA/MP16.1. Кроме того, уровни CCL2, IL-12p70, IFN-γ, TNF-α и TGF-β измеряли в образцах сыворотки всех участников с использованием коммерчески доступных наборов. Выполненный анализ показал, что гомозиготный мутантный вариант по обоим генотипам -2518 GG (OR = 2,07, p = 0,02) и -362 CC (OR = 1,92, p = 0,03) был связан с предрасположенностью к легочному ТБ. Кроме того, гетерозиготные генотипы -2518AG (OR = 0,60, p = 0,003) и -362GC (OR = 0,64, p = 0,013) обеспечивают устойчивость к заболеванию ТБЛ. Анализ гаплотипов показал, что гаплотип AC (p = 0,006) является фактором риска, связанным с восприимчивостью к ТБЛ. Уровень CCL2 в сыворотке был значительно повышен среди участников с генотипом -2518 AA по сравнению с генотипом -2518 GG. Было обнаружено, что уровень CCL2 положительно коррелирует с IL12p70, IFN-γ и TNF-α, что позволяет предположить иммунологическую регуляторную роль CCL2 против туберкулеза легких. Было обнаружено, что генотипы CCL2-2518 GG и -362 CC связаны с чувствительностью к туберкулезу легких, а CCL2-2518AG и CCL2-362GC - с устойчивостью к ТБЛ. В настоящем исследовании было обнаружено, что гаплотип AC является фактором риска развития ТБЛ. На основании результатов можно предположить, что аллель -2518G может быть ответственным за более низкую продукцию CCL2, что приводит к дефектному ответу Th1 и делает хозяина восприимчивым к туберкулезу легких.

3.    «Полиморфизм C-реактивного белка +444C/T связан с предрасположенностью к туберкулезу легких»

Журнал: BioMed Research International (IF = 2.583, Q2)

Ссылка: https://doi.org/10.1155/2020/6634879

Как описано в литературе аллель T полиморфизма C-реактивного белка (СРБ) + 1444C/T (rs1130864) связан с повышенным риском ряда воспалительных состояний. Целью исследования являлось изучение ассоциации между полиморфизмом СРБ + 1444C/T и чувствительностью к туберкулезу легких (ТБЛ) у населения Китая. В это исследование случай-контроль было включено 480 пациентов с ТБЛ и 480 здоровых людей из контрольной группы. Полиморфизм СРБ + 1444C/T определяли с помощью секвенирования по Сэнгеру. Отношение шансов (OR) и 95% доверительный интервал (CI) использовались для оценки силы генетической корреляции. Показано, что частоты генотипов и аллелей у пациентов с ТБЛ отличались от контроля (CT против CC, OR = 1,924, 95% CI: 1,099–3,371, скорректированное значение P = 0,022; T против C, OR = 1,884, 95% CI: 1,085- 3,273, скорректированное значение P = 0,024). Стратифицированный анализ по полу показал, что частоты генотипов и аллелей пациентов с ТБЛ отличались от контрольной только в мужской подгруппе, но не в женской. На основании проведенного исследования авторы делают заключение, что минорный аллель T полиморфизма СРБ + 1444C/T связан с повышенным риском ТБЛ.

4.     «Генетические факторы риска медикаментозного поражения печени из-за схем лечения туберкулеза, содержащих изониазид»

Журнал: Clinical Pharmacology and Therapeutics (IF =7.266, Q1)

Ссылка: https://doi.org/10.1002/cpt.2100

Лекарственное поражение печени (ЛПП) является осложнением лечения противотуберкулезными (ТБ) препаратами, особенно в схемах, содержащих изониазид. Чтобы изучить генетические факторы риска, авторы провели исследование ассоциации в масштабе всего генома (GWAS), в котором участвовали случаи ЛПП при лечении туберкулеза (55 человек в Индии и 70 в Европе) и контрольная группа (1199 человек в Индии и 10 397 в Европе). Большинство пациентов лечились по стандартной схеме лечения туберкулезом; все получили изониазид. Авторы изучали однонуклеотидные полиморфизмы и генотипы HLA и выполнили трансэтнический мета-анализ генотипов GWAS и генов-кандидатов. GWAS обнаружил одну значимую ассоциацию (rs117491755) только у европейцев. Для HLA HLA-B*52:01 был значимым (OR 2,67, 95% CI 1,63–4,37, P = 9,4 × 10–5). Для N-ацетилтрансферазы 2 (NAT2) частота NAT2*5 была ниже в группах ТЛ (OR 0,69, 95% CI 0,57–0,83, P = 0,01). NAT2*6 и NAT2*7 были более распространены, а гомозиготы по NAT2*6 и/или NAT2*7 значимо чаще встречались среди пациентов с ТЛ (OR 1,89, 95% CI 0,84–4,22, P = 0,004). Авторы делают заключение, что генотип HLA вносит небольшой вклад в ЛПП, связанное с лекарствами от ТБ, и что вклад NAT2 является сложным, но согласуется с предыдущими сообщениями, когда рассматриваются различия в метаболическом эффекте NAT2*5 по сравнению с таковыми NAT2*6 и NAT2*7.

5.    «Систематический обзор и метаанализ данных о связи между генами иммуноглобулиноподобных рецепторов клеток-киллеров и предрасположенностью к туберкулезу легких»

Журнал: Pathogens and Global Health (IF =1.969, Q1)

Ссылка: https://doi.org/10.1080/20477724.2020.1848271

В нескольких исследованиях оценивалась связь между генами иммуноглобулиноподобных рецепторов клеток-киллеров (KIR) и чувствительностью к инфекции туберкулеза (ТБ). Тем не менее, полученные результаты не были убедительными и последовательными. Авторы провели систематический обзор и метаанализ ассоциации генов KIR с риском инфекции легочного туберкулеза (ТБЛ), чтобы получить четкое представление об участии этих генов в чувствительности к данной инфекции. Был проведен систематический поиск в базах данных MEDLINE, PubMed и Scopus, чтобы найти исследования случай-контроль, опубликованные до ноября 2020 года. Для определения ассоциации использовали отношение шансов (OR) и 95% доверительный интервал (CI). После всестороннего поиска и применения критериев включения и исключения в метаанализ были включены 10 исследований случай-контроль. Было обнаружено, что четыре гена KIR имеют значимую положительную ассоциацию с риском заражения ТБЛ, включая 2DL3 (OR = 1,454, 95% CI = 1,157–1,827; P = 0,001), 2DS1 (OR = 1,481, 95% CI = 1,334–1,837). ; P <0,001), 2DS4 (OR = 1,782, 95% CI = 1,273–2,495; P = 0,001) и 3DL1 (OR = 1,726, 95% CI = 1,277–2,333; P <0,001). Однако результаты показали, что оставшиеся гены KIR (2DS2-4, 2DL1, 2, 4, 3DL1-2) и два псевдогена (2DP1 и 3DP1) не имели значимой связи с риском заражения ТБЛ. Данный метаанализ предоставляет доказательства того, что гены KIR 2DL3, 2DS1, 2DS4 и 3DL1 могут быть связаны с повышенным риском заражения туберкулезом легких.